1、暴雨影响线路安全：在狂风暴雨天气下，降雨量达到一定值后，会引发水漫线路、设备淹水的情况，同时路基和周边岩土吸水饱和后，可能出现塌方、泥石流等危害，都会影响行车安全。这时列车就需要限速运行，严重时，铁路部门要对区间进行封锁，待工务人员巡查后，确认线路安全，才能恢复列车正常运行。
2、异物影响供电安全：动车组、电力机车都需要电来驱动，给万里铁道线安全供电的，正是钢轨上方的铁路接触网设备，当铁路线旁的树枝、塑料袋等异物，因风雨飘挂到接触网设备上，将会迫使列车停车，异物被清除后才能继续运行。
3、暴雨影响司机视线：由于列车行驶速度快，当遭遇暴雨天气时，雨水会严重影响火车司机的视线，当司机瞭望距离低于规定值，列车就需要降速运行，以保证行车安全。
