主要区别在于：营养成分略不同、港版品种多样、经销公司不同、大陆有奶粉追溯系统。
区别一：营养成分略不同
港版美素比大陆版美素多了5种东西：鱼油、谷氨酸、谷氨酰胺、氢氧化钙、唾液酸。特别是谷氨酸、谷氨酰胺与核苷酸并列在罐体上大字突出以示其重要性，大陆版美美素佳儿没有。
区别二：港版品种多样
进入香港地区销售的美素佳儿奶粉产品包括：全能美素力、美素乐、美素高，金装美素力（0-6），金装美素高高蛋白质奶粉（6-36），金装美素高成长奶粉（1-3），金装美素高儿童成长奶粉（3以上），美素恩（孕妇奶粉）。 而在中国大陆销售的美素佳儿奶粉只包含了孕妇奶粉、1-4阶段的宝宝奶粉。
区别三：经销公司不同
美素佳儿进入到中国大陆和香港市场的时间不同，所属公司荷兰菲仕兰乳品公司在多年前就在香港销售美素奶粉。而在香港销售多年后，于1992年，美素佳儿系列婴幼儿奶粉进入中国大陆市场，由瑞士大昌洋行总代理。
区别四：大陆有奶粉追溯系统
大陆版美素佳儿有一个奶粉追溯系统，妈妈们可以通过美素佳儿官网追溯每罐奶粉从生产、包装、出入境检验及运输的每一步骤，能避免买到假货，而港版暂时没有。
