１、制作原料不同。海藻棉的制作原料是海藻纤维，而纯棉布料的制作原料则是棉花。
２、性能不同。由于两者在制作原料上存在区别，则性能也不同。虽然海藻棉和纯棉都具有保温性，但海藻棉的保温性明显要比纯棉布料的保温性更好。
３、用途不同。海藻棉大多被用来制作袜子和内衣，而纯棉布料则被用来制作衣服。
４、使用效果不同。因为海藻棉经过了很多特殊的处理，所以布料表面看起来更有光泽和色调，摸起来也更柔和，而且海藻棉在制作时经过了双面热烫处理，以及表面的高温烫处理，所以海藻棉布料不易变形。而纯棉布料则含很多棉纤维，所以吸湿性更好一些，这也是人们为什么使用纯棉布料做衣服和被子的原因。
